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This study was supported by grants to the PI, R.B., from the Ministerio de Economia, Industria y Competitividad (MEIC: SAF2013-44329-P, SAF2013-42359-ERC and RYC-2013-13209) and the European Research Council (ERC-2014-StG - 638028 AngioGenesHD). M.F. was supported by a PhD fellowship from Fundacion La Caixa (CX_E-201501) and W.L. by a FP7-PEOPLE-2012-COFUND GA600396 postdoctoral contract. We thank J.L. Pompa, G. Sabio, V. Andres, J.M. Redondo, F. Radtke, G. Breier, S. Martin, R.H. Adams, M. Torres, T. Schimmang and T. Honjo for sharing the Tie2-Cre, Alb-Cre, Ubc-CreERT2, MyHC-Cre, Dll4 and Notch1 floxed, Kdr floxed, Epas1 floxed, Cdh5(PAC)-CreERT2, Myc floxed, Mycn floxed and Rbpj floxed mice, respectively. We thank Simon Bartlett for English editing; Sofia Sanchez for help with the mouse colony; and all members of the CNIC gene targeting, transgenesis, cellomics, and microscopy units. The CNIC is supported by the Ministerio de Ciencia, Innovacion y Universidades (MCNU) and the Pro CNIC Foundation, and is a Severo Ochoa Center of Excellence (SEV-2015-0505).

Análisis de autorías institucional

Fernandez-Chacon, MacarenaAutor o Coautor

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Artículo

iSuRe-Cre is a genetic tool to reliably induce and report Cre-dependent genetic modifications

Publicado en:Nature Communications. 10 (2262): 2262- - 2019-12-01 10(2262), DOI: 10.1038/s41467-019-10239-4

Autores: Fernandez-Chacon, Macarena; Casquero-Garcia, Veronica; Luo, Wen; Francesca Lunella, Federica; Ferreira Rocha, Susana; Del Olmo-Cabrera, Sergio; Benedito, Rui;

Afiliaciones

CNIC, Mol Genet Angiogenesis Grp, E-28029 Madrid, Spain - Autor o Coautor

Resumen

Most biomedical research aimed at understanding gene function uses the Cre-Lox system, which consists of the Cre recombinase-dependent deletion of genes containing LoxP sites. This system enables conditional genetic modifications because the expression and activity of the recombinase Cre/CreERT2 can be regulated in space by tissue-specific promoters and in time by the ligand tamoxifen. Since the precise Cre-Lox recombination event is invisible, methods were developed to report Cre activity and are widely used. However, numerous studies have shown that expression of a given Cre activity reporter cannot be assumed to indicate deletion of other LoxP-flanked genes of interest. Here, we report the generation of an inducible dual reporter-Cre mouse allele, iSuRe-Cre. By significantly increasing Cre activity in reporter-expressing cells, iSuRe-Cre provides certainty that these cells have completely recombined floxed alleles. This genetic tool increases the ease, efficiency, and reliability of conditional mutagenesis and gene function analysis.

Palabras clave

CellsEfficiencyExpressionInhibitionKnockoutLigandLoxpMycRecombinationTransgenic mice

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Nature Communications debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2019, se encontraba en la posición 6/71, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Multidisciplinary Sciences. Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada por encima del Percentil 90.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir de las Citas Mundiales de Scopus Elsevier, arroja un valor para la media Ponderada del Impacto Normalizado de la agencia Scopus: 1.27, lo que indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: ESI 14 Nov 2024)

Esta información viene reforzada por otros indicadores del mismo tipo, que aunque dinámicos en el tiempo y dependientes del conjunto de citaciones medias mundiales en el momento de su cálculo, coinciden en posicionar en algún momento al trabajo, entre el 50% más citados dentro de su temática:

  • Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions: 6.15 (fuente consultada: Dimensions Jun 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-06-30, el siguiente número de citas:

  • WoS: 19
  • Scopus: 33
  • Europe PMC: 21

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-06-30:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 145.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 145 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 34.6.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 29 (Altmetric).
  • El número de menciones en medios de comunicación: 2 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (FERNANDEZ CHACON, MACARENA) .