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Yébenes LAutor (correspondencia)Angulo AAutor (correspondencia)Zamora PAutor (correspondencia)Sánchez-Mendez JAutor (correspondencia)Espinosa EAutor (correspondencia)Redondo AAutor (correspondencia)Feliu JAutor (correspondencia)Hardisson DAutor (correspondencia)
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Comparison of risk classification between EndoPredict and MammaPrint in ER-positive/HER2-negative primary invasive breast cancer

Publicado en:PLoS ONE. 12 (9): e0183452-e0183452 - 2017-01-01 12(9), DOI: 10.1371/journal.pone.0183452

Autores: Peláez-García A; Yébenes L; Berjón A; Angulo A; Zamora P; Sánchez-Méndez J; Espinosa E; Redondo A; Heredia-Soto V; Mendiola M; Feliú J; Hardisson D

Afiliaciones

Hosp Univ La Paz, Dept Obstet & Gynecol, IdiPAZ, Breast Canc Unit, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Hosp Univ La Paz, Dept Pathol, IdiPAZ, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Hosp Univ La Paz, IdiPAZ, Dept Med Oncol, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Hosp Univ La Paz, INGEMM, IdiPAZ, Mol Pathol Diagnost Unit, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Hosp Univ La Paz, Mol Pathol & Therapeut Targets Grp, IdiPAZ, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Hosp Univ La Paz, Translat Oncol Grp, IdiPAZ, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Hospital Universitario La Paz - Autor o Coautor
Instituto de Salud Carlos III - Autor o Coautor
Minist Econ Ind & Competitividad, Inst Salud Carlos III, Ctr Invest Biorned Red Canc CIBERONC, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Myriad Genet Espana SLU, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Myriad Genetics España SLU - Autor o Coautor
Univ Autonoma Madrid, Fac Med, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Universidad Autonoma de Madrid, Facultad de Medicina - Autor o Coautor
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Resumen

To compare the concordance in risk classification between the EndoPredict and the MammaPrint scores obtained for the same cancer samples on 40 estrogen-receptor positive/HER2-negative breast carcinomas.Formalin-fixed, paraffin-embedded invasive breast carcinoma tissues that were previously analyzed with MammaPrint as part of routine care of the patients, and were classified as high-risk (20 patients) and low-risk (20 patients), were selected to be analyzed by the EndoPredict assay, a second generation gene expression test that combines expression of 8 genes (EP score) with two clinicopathological variables (tumor size and nodal status, EPclin score).The EP score classified 15 patients as low-risk and 25 patients as high-risk. EPclin re-classified 5 of the 25 EP high-risk patients into low-risk, resulting in a total of 20 high-risk and 20 low-risk tumors. EP score and MammaPrint score were significantly correlated (p = 0.008). Twelve of 20 samples classified as low-risk by MammaPrint were also low-risk by EP score (60%). 17 of 20 MammaPrint high-risk tumors were also high-risk by EP score. The overall concordance between EP score and MammaPrint was 72.5% (? = 0.45, (95% CI, 0.182 to 0.718)). EPclin score also correlated with MammaPrint results (p = 0.004). Discrepancies between both tests occurred in 10 cases: 5 MammaPrint low-risk patients were classified as EPclin high-risk and 5 high-risk MammaPrint were classified as low-risk by EPclin and overall concordance of 75% (? = 0.5, (95% CI, 0.232 to 0.768)).This pilot study demonstrates a limited concordance between MammaPrint and EndoPredict. Differences in results could be explained by the inclusion of different gene sets in each platform, the use of different methodology, and the inclusion of clinicopathological parameters, such as tumor size and nodal status, in the EndoPredict test.

Palabras clave
7-dehydrocholesterol reductaseAdipokinesAzgp1 protein, humanBirc5 protein, humanBreast neoplasmsCalcium-binding proteinsCalm2 protein, humanCalmodulinCarrier proteinsCytokine receptor gp130Extracellular matrix proteinsFemaleGlycoproteinsGood health and well-beingHumansIl6st protein, humanImmunohistochemistryIn vitro techniquesInhibitor of apoptosis proteinsIntercellular signaling peptides and proteinsKi-67 antigenMatrix gla proteinMiddle agedOrnithine decarboxylase antizymeOxidoreductases acting on ch-ch group donorsProteinsReceptor, erbb-2Receptors, estrogenReceptors, progesteroneRibosomal proteinsRpl37a protein, humanStc2 protein, humanSurvivinUbe2c protein, humanUbiquitin-conjugating enzymes

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista PLoS ONE debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2017, se encontraba en la posición 15/64, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Multidisciplinary Sciences.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir del Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions, arroja un valor de: 1.92, lo que indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: Dimensions May 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-05-06, el siguiente número de citas:

  • WoS: 11
  • Scopus: 12
  • Europe PMC: 4
  • OpenCitations: 11
Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-05-06:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 49.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 49 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 13.35.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 7 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
  • Asignación de un Handle/URN como identificador dentro del Depósito en el Repositorio Institucional: https://repositorio.uam.es/handle/10486/681149
Siguiendo con el impacto social del trabajo, es importante enfatizar el hecho de que, por su contenido, puede ser asignado a la línea de interés del ODS 3 - Garantizar una vida sana y promover el bienestar para todos en todas las edades, con una probabilidad del 47% según el algoritmo mBERT desarrollado por Aurora University.
Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Último Autor (HARDISSON HERNAEZ, DAVID ALONSO).

los autores responsables de establecer las labores de correspondencia han sido GOENAGA SANCHEZ, AMAIA, SACRISTAN ROMERO, FRANCISCO, ZAMORA AUÑON, MARIA DEL PILAR, SANCHEZ MENDEZ, JOSE IGNACIO, ESPINOSA ARRANZ, ENRIQUE, REDONDO SANCHEZ, ANDRES, FELIU BATLLE, JAIME y HARDISSON HERNAEZ, DAVID ALONSO.