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Grant support

This research was funded by the Ministerio de Ciencia, Innovacion y Universidades, Spain (RTI2018-094985-B-100). BFSS is supported by a scholarship from CNPq Conselho Nacional de Desenvolvimento Cientifico e Tecnologico-GDE-204842/2018-2. L.T. is supported by scholarships from the National Exceptional Program (PNE), Ministry of Higher Education and Scientific research of Algeria and from the Erasmus + Program project 2019-1-ES01-KA107-063778. EG is supported by the ANR grants "SymEffectors" and "ET-Nod" (ANR-16-CE20-0013 and ANR-20-CE20-0012, respectively).

Análisis de autorías institucional

De Sousa, B F SAutor o Coautor

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Artículo

The Bradyrhizobium Sp. LmicA16 Type VI Secretion System Is Required for Efficient Nodulation of Lupinus Spp.

Publicado en:MICROBIAL ECOLOGY. 84 (3): 844-855 - 2022-10-01 84(3), DOI: 10.1007/s00248-021-01892-8

Autores: Tighilt, L; Boulila, F; De Sousa, B F S; Giraud, E; Ruiz-Argueso, T; Palacios, J M; Imperial, J; Rey, L

Afiliaciones

CSIC, Inst Ciencias Agr, E-28006 Madrid, Spain - Autor o Coautor
Univ Bejaia, Fac Sci Nat & Vie, Lab Ecol Microbienne, Bejaia 06000, Algeria - Autor o Coautor
Univ Montpellier, CIRAD, IRD,INRA, Lab Symbioses Trop & Mediterraneennes LSTM,SupAgr, TA-A82-J Campus Int Baillarguet, F-34398 Montpellier 5, France - Autor o Coautor
Univ Politecn Madrid UPM, Ctr Biotecnol & Genom Plantas, Inst Nacl Invest & Tecnol Agr & Alimentaria INIA, Campus Montegancedo, Madrid 28223, Spain - Autor o Coautor
Univ Politecn Madrid, Dept Biotecnol & Biol Vegetal, ETSI Agron Alimentaria & Biosistemas, E-28040 Madrid, Spain - Autor o Coautor
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Resumen

Many bacteria of the genus Bradyrhizobium are capable of inducing nodules in legumes. In this work, the importance of a type VI secretion system (T6SS) in a symbiotic strain of the genus Bradyrhizobium is described. T6SS of Bradyrhizobium sp. LmicA16 (A16) is necessary for efficient nodulation with Lupinus micranthus and Lupinus angustifolius. A mutant in the gene vgrG, coding for a component of the T6SS nanostructure, induced less nodules and smaller plants than the wild-type (wt) strain and was less competitive when co-inoculated with the wt strain. A16 T6SS genes are organized in a 26-kb DNA region in two divergent gene clusters of nine genes each. One of these genes codes for a protein (Tsb1) of unknown function but containing a methyltransferase domain. A tsb1 mutant showed an intermediate symbiotic phenotype regarding vgrG mutant and higher mucoidity than the wt strain in free-living conditions. T6SS promoter fusions to the lacZ reporter indicate expression in nodules but not in free-living cells grown in different media and conditions. The analysis of nodule structure revealed that the level of nodule colonization was significantly reduced in the mutants with respect to the wt strain.

Palabras clave

BradyrhizobiumDiversityEffectorLocuLupinusMethyltransferasMethyltransferasePhylogenyRhizobium-legume symbiosisRhizobium–legume symbiosisRoot nodules, plantStrainsSymbiosisType vi secretionType vi secretion systems

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista MICROBIAL ECOLOGY debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2022, se encontraba en la posición 10/109, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Marine & Freshwater Biology. Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada por encima del Percentil 90.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir de las Citas Mundiales proporcionadas por WoS (ESI, Clarivate), arroja un valor para la normalización de citas relativas a la tasa de citación esperada de: 2.48. Esto indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: ESI 14 Nov 2024)

Esta información viene reforzada por otros indicadores del mismo tipo, que aunque dinámicos en el tiempo y dependientes del conjunto de citaciones medias mundiales en el momento de su cálculo, coinciden en posicionar en algún momento al trabajo, entre el 50% más citados dentro de su temática:

  • Media Ponderada del Impacto Normalizado de la agencia Scopus: 4 (fuente consultada: FECYT Feb 2024)
  • Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions: 2.37 (fuente consultada: Dimensions Jun 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-06-30, el siguiente número de citas:

  • WoS: 8
  • Scopus: 14
  • Europe PMC: 5

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-06-30:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 25.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 25 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 3.1.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 5 (Altmetric).

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Algeria; France.