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Análisis de autorías institucional

Blanco-Romero EAutor o CoautorDuran DAutor o CoautorGarrido-Sanz DAutor o CoautorRedondo-Nieto MAutor o CoautorMartin MAutor o CoautorRivilla RAutor (correspondencia)

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Review

Adaption of pseudomonas ogarae F113 to the Rhizosphere Environment—the amrz-fleq hub

Publicado en:Microorganisms. 11 (4): 1037- - 2023-04-01 11(4), DOI: 10.3390/microorganisms11041037

Autores: Blanco-Romero, Esther; Duran, David; Garrido-Sanz, Daniel; Redondo-Nieto, Miguel; Martin, Marta; Rivilla, Rafael

Afiliaciones

Univ Autonoma Madrid, Fac Ciencias, Dept Biol, Darwin 2, Madrid 28049, Spain - Autor o Coautor
Univ Lausanne, Dept Fundamental Microbiol, CH-1015 Lausanne, Switzerland - Autor o Coautor
Universidad Autónoma de Madrid - Autor o Coautor
Universidad Autónoma de Madrid , Université de Lausanne (UNIL) - Autor o Coautor

Resumen

Motility and biofilm formation are two crucial traits in the process of rhizosphere colonization by pseudomonads. The regulation of both traits requires a complex signaling network that is coordinated by the AmrZ-FleQ hub. In this review, we describe the role of this hub in the adaption to the rhizosphere. The study of the direct regulon of AmrZ and the phenotypic analyses of an amrZ mutant in Pseudomonas ogarae F113 has shown that this protein plays a crucial role in the regulation of several cellular functions, including motility, biofilm formation, iron homeostasis, and bis-(3′-5′)-cyclic dimeric guanosine monophosphate (c-di-GMP) turnover, controlling the synthesis of extracellular matrix components. On the other hand, FleQ is the master regulator of flagellar synthesis in P. ogarae F113 and other pseudomonads, but its implication in the regulation of multiple traits related with environmental adaption has been shown. Genomic scale studies (ChIP-Seq and RNA-Seq) have shown that in P. ogarae F113, AmrZ and FleQ are general transcription factors that regulate multiple traits. It has also been shown that there is a common regulon shared by the two transcription factors. Moreover, these studies have shown that AmrZ and FleQ form a regulatory hub that inversely regulate traits such as motility, extracellular matrix component production, and iron homeostasis. The messenger molecule c-di-GMP plays an essential role in this hub since its production is regulated by AmrZ and it is sensed by FleQ and required for its regulatory role. This regulatory hub is functional both in culture and in the rhizosphere, indicating that the AmrZ-FleQ hub is a main player of P. ogarae F113 adaption to the rhizosphere environment.

Palabras clave

biofilmbiofilm formationc-di-gmpchemotaxis sensory proteinscyclic di-gmpenvironmental adaptionextracellular matrixfluorescens f113gene-expressionmotilityplant-growthpseudomonadsregulationrhizosphereroot colonizationtranscription factorstwitching motilityvi secretion systemsBiofilmC-di-gmpDna-binding proteinEnvironmental adaptionExtracellular matrixMotilityPseudomonadsRegulationRhizosphereTranscription factors

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Microorganisms debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2023, se encontraba en la posición 49/161, consiguiendo con ello situarse como revista Q2 (Segundo Cuartil), en la categoría Microbiology. Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada en el Cuartil Q2 para la agencia Scopus (SJR) en la categoría Microbiology (Medical).

2025-06-13:

  • WoS: 2
  • Scopus: 2
  • Europe PMC: 2
  • OpenCitations: 1

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-06-13:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 12.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 12 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 1.25.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 2 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
  • Asignación de un Handle/URN como identificador dentro del Depósito en el Repositorio Institucional: https://repositorio.uam.es/handle/10486/707753

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Este trabajo se ha realizado con colaboración internacional, concretamente con investigadores de: Switzerland.

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (BLANCO ROMERO, ESTHER) y Último Autor (RIVILLA PALMA, RAFAEL).

el autor responsable de establecer las labores de correspondencia ha sido RIVILLA PALMA, RAFAEL.