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Ugarte MAutor o CoautorRodriguez-Pombo PAutor o CoautorPerez BAutor (correspondencia)

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26 de diciembre de 2022
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Artículo
Sí

Pathogenic variants of the coenzyme A biosynthesis-associated enzyme phosphopantothenoylcysteine decarboxylase (PPCDC) cause autosomal-recessive dilated cardiomyopathy

Publicado en: Journal Of Inherited Metabolic Disease. 46 (2): 261-272 - 2023-03-01 46(2), DOI: 10.1002/jimd.12584

Autores:

Bravo-Alonso, I; Morin, M; Arribas-Carreira, L; Alvarez, M; Pedrón-Giner, C; Soletto, L; Santolaria, C; Ramón-Maiques, S; Ugarte, M; Rodríguez-Pombo, P; Ariño, J; Moreno-Pelayo, MA; Pérez, B
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Afiliaciones

Centro de Diagnóstico de Enfermedades Moleculares, Centro de Biología Molecular, Universidad Autónoma de Madrid, CIBERER, IdiPAZ, Madrid, Spain. - Autor o Coautor
CIBERER-ISCIII), Madrid, Spain. - Autor o Coautor
Hosp Infantil Univ Nino Jesus, Secc Gastroenterol & Nutr, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Hosp Univ Ramon y Cajal, Serv Genet, IRYCIS, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Inst Biomed Valencia IBV CSIC CIBERER, Valencia, Spain - Autor o Coautor
Inst Salud Carlos III CB06 07 0048 CIBERER ISCIII, Ctr Invest Biomed Red Enfermedades Raras, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Institut de Biotecnologia i Biomedicina & Departament de Bioquímica i Biologia Molecular, Universitat Autònoma de Barcelona, Cerdanyola del Vallès, Spain. - Autor o Coautor
Instituto de Biomedicina de Valencia (IBV) CSIC, Valencia, Spain. - Autor o Coautor
Sección de Gastroenterología y Nutrición, Hospital Infantil Universitario Niño Jesús, Av. de Menéndez Pelayo 65, Madrid, Spain. - Autor o Coautor
Servicio de Genética, Hospital Universitario Ramón y Cajal, IRYCIS, Carretera de Colmenar km 9.100, 28034 Madrid, Spain. Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Raras, Instituto de Salud Carlos III (CB06/07/0048 - Autor o Coautor
Univ Autonoma Barcelona, Inst Biotecnol & Biomed, Cerdanyola Del Valles, Spain - Autor o Coautor
Univ Autonoma Madrid, Ctr Diagnost Enfermedades Mol, Ctr Biol Mol, IdiPAZ, Madrid 28049, Spain - Autor o Coautor
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Resumen

Coenzyme A (CoA) is an essential cofactor involved in a range of metabolic pathways including the activation of long-chain fatty acids for catabolism. Cells synthesize CoA de novo from vitamin B5 (pantothenate) via a pathway strongly conserved across prokaryotes and eukaryotes. In humans, it involves five enzymatic steps catalyzed by four enzymes: pantothenate kinase (PANK [isoforms 1-4]), 4'-phosphopantothenoylcysteine synthetase (PPCS), phosphopantothenoylcysteine decarboxylase (PPCDC), and CoA synthase (COASY). To date, inborn errors of metabolism associated with all of these genes, except PPCDC, have been described, two related to neurodegeneration with brain iron accumulation (NBIA), and one associated with a cardiac phenotype. This paper reports another defect in this pathway (detected in two sisters), associated with a fatal cardiac phenotype, caused by biallelic variants (p.Thr53Pro and p.Ala95Val) of PPCDC. PPCDC enzyme (EC 4.1.1.36) catalyzes the decarboxylation of 4'-phosphopantothenoylcysteine to 4'-phosphopantetheine in CoA biosynthesis. The variants p.Thr53Pro and p.Ala95Val affect residues highly conserved across different species; p.Thr53Pro is involved in the binding of flavin mononucleotide, and p.Ala95Val is likely a destabilizing mutation. Patient-derived fibroblasts showed an absence of PPCDC protein, and nearly 50% reductions in CoA levels. The cells showed clear energy deficiency problems, with defects in mitochondrial respiration, , and mostly glycolytic ATP synthesis. Functional studies performed in yeast suggest these mutations to be functionally relevant. In summary, this work describes a new, ultra-rare, severe inborn error of metabolism due to pathogenic variants of PPCDC.This article is protected by copyright. All rights reserved.
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Palabras clave

coadilated cardiomyopathygenehal3inborn errors of metabolisminhibitory subunitmutationspank2ppcdcsaccharomyces-cerevisiaesit4yeastBiosynthesis of coenzyme aCarboxy-lyasesCardiomyopathy, dilatedCoenzyme aDilated cardiomyopathyFunctional-characterizationHeartHumansInborn errors of metabolismPhosphopantothenoyl-cysteine decarboxylasePpcdcSaccharomyces cerevisiae

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Journal of Inherited Metabolic Disease debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2023, se encontraba en la posición 37/191, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Genetics & Heredity.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir de las Citas Mundiales proporcionadas por WoS (ESI, Clarivate), arroja un valor para la normalización de citas relativas a la tasa de citación esperada de: 2.81. Esto indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: ESI 13 Nov 2025)

Esta información viene reforzada por otros indicadores del mismo tipo, que aunque dinámicos en el tiempo y dependientes del conjunto de citaciones medias mundiales en el momento de su cálculo, coinciden en posicionar en algún momento al trabajo, entre el 50% más citados dentro de su temática:

  • Media Ponderada del Impacto Normalizado de la agencia Scopus: 1.29 (fuente consultada: FECYT Mar 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2026-04-05, el siguiente número de citas:

  • WoS: 15
  • Scopus: 8
  • Europe PMC: 4
  • Google Scholar: 9
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Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2026-04-05:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 20.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 20 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 8.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 11 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
  • Asignación de un Handle/URN como identificador dentro del Depósito en el Repositorio Institucional: https://repositorio.uam.es/handle/10486/705989
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Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (Bravo-Alonso I) y Último Autor (PEREZ GONZALEZ, MARIA BELEN).

el autor responsable de establecer las labores de correspondencia ha sido PEREZ GONZALEZ, MARIA BELEN.

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Reconocimientos ligados al ítem

This work was funded by the Instituto de Salud Carlos (ISCIII), the European Regional Development Fund [PI19/01155], the Ministerio de Economia, Industria y Competitividad, Spain (BFU2017-82574-P), and the Consejeria de Educacion, Juventud y Deporte, Comunidad de Madrid [B2017/BMD3721].
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