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Review

When should we order a next generation sequencing test in a patient with cancer?

Publicado en:EClinicalMedicine. 25 100487-100487 - 2020-08-01 25(), DOI: 10.1016/j.eclinm.2020.100487

Autores: Colomer, Ramon; Mondejar, Rebeca; Romero-Laorden, Nuria; Alfranca, Arantzazu; Sanchez-Madrid, Francisco; Quintela-Fandino, Miguel

Afiliaciones

Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO), Madrid, Spain. - Autor o Coautor
Ctr Nacl Invest Oncol CNIO, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Departament of Medicine, Universidad Autónoma de Madrid (UAM), Spain. - Autor o Coautor
Endowed Chair of Personalised Precision Medicine, Universidad Autónoma de Madrid (UAM)-Fundación Instituto Roche, Spain. - Autor o Coautor
Hosp Univ La Princesa, Immunol Div, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Hosp Univ La Princesa, Med Oncol Div, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Hosp Univ Quiron, Med Oncol Div, Pozuelo De Alarcon Madri, Spain - Autor o Coautor
Immunology Division, Hospital Universitario La Princesa, Madrid, Spain. - Autor o Coautor
Medical Oncology Division, Hospital Universitario La Princesa, Madrid, Spain. - Autor o Coautor
Medical Oncology Division, Hospital Universitario Quirón, Pozuelo de Alarcón - Madrid, Spain. - Autor o Coautor
Univ Autonoma Madrid UAM, Dept Med, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Univ Autonoma Madrid UAM, Endowed Chair Personalised Precis Med, Fdn Inst Roche, Madrid, Spain - Autor o Coautor
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Resumen

Technical advances in genome sequencing and the implementation of next-generation sequencing (NGS) in clinical oncology have paved the way for individualizing cancer patient therapy based on molecular profiles. When and how to use NGS testing in the clinic is at present an unsolved issue, although new research results provide evidence favoring this approach in some types of advanced cancer. Clinical research is evolving rapidly, from basket and umbrella trials to adaptative design precision oncology clinical studies, and genomic and molecular data often displace the classical clinical validation procedures of biomarkers. In this context, physicians must be aware of the clinical evidence behind these new biomarkers and NGS tests available, in order to use them in the right moment, and with a critical point of view. This review will present the status of currently available targeted drugs that can be effective based on actionable molecular alterations, and the NGS tests that are currently available, offering a practical guide for the application of Clinical Precision Oncology in the real world routine practice.© 2020 The Author(s).

Palabras clave

Cancer genomicsCancer therapyNext generation sequencingPersonalised medicinePrecision oncologyTargeted therapy

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista EClinicalMedicine debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia Scopus (SJR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2020, se encontraba en la posición , consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Medicine (Miscellaneous). Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada por encima del Percentil 90.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir de las Citas Mundiales de Scopus Elsevier, arroja un valor para la media Ponderada del Impacto Normalizado de la agencia Scopus: 8.12, lo que indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: ESI 14 Nov 2024)

Esta información viene reforzada por otros indicadores del mismo tipo, que aunque dinámicos en el tiempo y dependientes del conjunto de citaciones medias mundiales en el momento de su cálculo, coinciden en posicionar en algún momento al trabajo, entre el 50% más citados dentro de su temática:

  • Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions: 32.91 (fuente consultada: Dimensions Jun 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-06-29, el siguiente número de citas:

  • WoS: 103
  • Scopus: 112
  • Europe PMC: 70
  • Google Scholar: 149

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-06-29:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 213.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 232 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 61.55.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 16 (Altmetric).
  • El número de menciones en Wikipedia: 1 (Altmetric).
  • El número de menciones en medios de comunicación: 6 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
  • Asignación de un Handle/URN como identificador dentro del Depósito en el Repositorio Institucional: https://repositorio.uam.es/handle/10486/696022

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (COLOMER BOSCH, RAMON) y Último Autor (QUINTELA FANDIÑO, MIGUEL ANGEL).