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Artículo

Into the Thermus Mobilome: Presence, Diversity and Recent Activities of Insertion Sequences Across Thermus spp

Publicado en:Microorganisms. 7 (1): - 2019-01-01 7(1), DOI: 10.3390/microorganisms7010025

Autores: Blesa A, Sánchez M, Sacristán-Horcajada E, González-de la Fuente S, Peiró R, Berenguer J

Afiliaciones

ALBA - Autor o Coautor
Centro de Biología Molecular Severo Ochoa (CBMSO), Universidad Autónoma de Madrid-Consejo Superior de Investigaciones Científicas, Madrid 28049, Spain - Autor o Coautor
CSIC - Autor o Coautor
Department of Biotechnology, Faculty of Experimental Sciences, Universidad Francisco de Vitoria, Madrid 28223, Spain - Autor o Coautor

Resumen

A high level of transposon-mediated genome rearrangement is a common trait among microorganisms isolated from thermal environments, probably contributing to the extraordinary genomic plasticity and horizontal gene transfer (HGT) observed in these habitats. In this work, active and inactive insertion sequences (ISs) spanning the sequenced members of the genus Thermus were characterized, with special emphasis on three T. thermophilus strains: HB27, HB8, and NAR1. A large number of full ISs and fragments derived from different IS families were found, concentrating within megaplasmids present in most isolates. Potentially active ISs were identified through analysis of transposase integrity, and domestication-related transposition events of ISTth7 were identified in laboratory-adapted HB27 derivatives. Many partial copies of ISs appeared throughout the genome, which may serve as specific targets for homologous recombination contributing to genome rearrangement. Moreover, recruitment of IS1000 32 bp segments as spacers for CRISPR sequence was identified, pointing to the adaptability of these elements in the biology of these thermophiles. Further knowledge about the activity and functional diversity of ISs in this genus may contribute to the generation of engineered transposons as new genetic tools, and enrich our understanding of the outstanding plasticity shown by these thermophiles.

Palabras clave

HgtInsertion sequenceMobilomeThermophilesThermusTransposasesTransposons

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Microorganisms debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2019, se encontraba en la posición 37/136, consiguiendo con ello situarse como revista Q2 (Segundo Cuartil), en la categoría Microbiology.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir del Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions, arroja un valor de: 2.02, lo que indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: Dimensions Jun 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-06-24, el siguiente número de citas:

  • WoS: 13
  • Scopus: 15
  • Europe PMC: 11
  • OpenCitations: 16

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-06-24:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 28.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 28 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 0.5.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 1 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
  • Asignación de un Handle/URN como identificador dentro del Depósito en el Repositorio Institucional: https://repositorio.uam.es/handle/10486/690104

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (BLESA ESTEBAN, ALBA) y Último Autor (BERENGUER CARLOS, JOSE).