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Gene signatures of early response to anti-TNF drugs in pediatric inflammatory bowel disease

Publicado en:INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES. 21 (9): - 2020-05-01 21(9), DOI: 10.3390/ijms21093364

Autores: Salvador-Martín S; Raposo-Gutiérrez I; Navas-López VM; Gallego-Fernández C; Moreno-álvarez A; Solar-Boga A; Muñoz-Codoceo R; Magallares L; Martínez-Ojinaga E; Fobelo MJ; Millán-Jiménez A; Rodriguez-Martinez A; Vayo CA; Sánchez C; Tolin M; Bossacoma F; Pujol-Muncunill G; de Caldas RG; Loverdos I; Blanca-García JA; Segarra O; Eizaguirre FJ; García-Romero R; Merino-Bohórquez V; Sanjurjo-Sáez M; López-Fernández LA

Afiliaciones

Hospital de Sabadell - Autor o Coautor
Hospital Infantil Universitario Niño Jesús de Madrid - Autor o Coautor
Hospital Miguel Servet - Autor o Coautor
Hospital Regional Universitario Carlos Haya - Autor o Coautor
Hospital Sant Joan de Déu - Autor o Coautor
Hospital Universitari de Bellvitge - Autor o Coautor
Hospital Universitario de Valme - Autor o Coautor
Hospital Universitario La Paz - Autor o Coautor
Hospital Universitario Puerta del Mar - Autor o Coautor
Hospital Universitario Reina Sofía - Autor o Coautor
HOSPITAL UNIVERSITARIO VIRGEN DEL ROCIO - Autor o Coautor
Hospital Universitario Virgen Macarena - Autor o Coautor
Instituto de Investigación Sanitaria Gregorio Marañón - Autor o Coautor
Osakidetza, Donostia University Hospital - Autor o Coautor
Universidade da Coruña - Autor o Coautor
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Resumen

© 2020 by the authors. Licensee MDPI, Basel, Switzerland. T. Around a 20–30% of inflammatory bowel disease (IBD) patients are diagnosed before they are 18 years old. Anti-TNF drugs can induce and maintain remission in IBD, however, up to 30% of patients do not respond. The aim of the work was to identify markers that would predict an early response to anti-TNF drugs in pediatric patients with IBD. The study population included 43 patients aged <18 years with IBD who started treatment with infliximab or adalimumab. Patients were classified into primary responders (n = 27) and non-responders to anti-TNF therapy (n = 6). Response to treatment could not be analyzed in 10 patients. Response was defined as a decrease in over 15 points in the disease activity indexes from week 0 to week 10 of infliximab treatment or from week 0 to week 26 of adalimumab treatment. The expression profiles of nine genes in total RNA isolated from the whole-blood of pediatric IBD patients taken before biologic administration and after 2 weeks were analyzed using qPCR and the 2−∆∆Ct method. Before initiation and after 2 weeks of treatment the expression of SMAD7 was decreased in patients who were considered as non-responders (p value < 0.05). Changes in expression were also observed for TLR2 at T0 and T2, although that did not reach the level of statistical significance. In addition, the expression of DEFA5 decreased 1.75-fold during the first 2 weeks of anti-TNF treatment in responders, whereas no changes were observed in non-responders. Expression of the SMAD7 gene is a pharmacogenomic biomarker of early response to anti-TNF agents in pediatric IBD. TLR2 and DEFA5 need to be validated in larger studies.

Palabras clave

adalimumabbiomarkercrohn’s diseasegene expressioninfliximabAdalimumabBiomarkerCrohn’s diseaseGene expressionInfliximabUlcerative colitis

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2020, se encontraba en la posición 67/298, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Biochemistry & Molecular Biology.

Desde una perspectiva relativa, y atendiendo al indicador del impacto normalizado calculado a partir de las Citas Mundiales de Scopus Elsevier, arroja un valor para la media Ponderada del Impacto Normalizado de la agencia Scopus: 1.1, lo que indica que, de manera comparada con trabajos en la misma disciplina y en el mismo año de publicación, lo ubica como trabajo citado por encima de la media. (fuente consultada: ESI 14 Nov 2024)

Esta información viene reforzada por otros indicadores del mismo tipo, que aunque dinámicos en el tiempo y dependientes del conjunto de citaciones medias mundiales en el momento de su cálculo, coinciden en posicionar en algún momento al trabajo, entre el 50% más citados dentro de su temática:

  • Field Citation Ratio (FCR) de la fuente Dimensions: 2.91 (fuente consultada: Dimensions Jun 2025)

De manera concreta y atendiendo a las diferentes agencias de indexación, el trabajo ha acumulado, hasta la fecha 2025-06-28, el siguiente número de citas:

  • WoS: 14
  • Scopus: 21
  • Europe PMC: 15

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-06-28:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 49.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 49 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 0.75.
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 2 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

  • El trabajo se ha enviado a una revista cuya política editorial permite la publicación en abierto Open Access.
  • Asignación de un Handle/URN como identificador dentro del Depósito en el Repositorio Institucional: https://repositorio.uam.es/handle/10486/693627