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Zarzo Arias, AlejandraAutor o CoautorMateo R.g.Autor o CoautorMorales-Barbero J.Autor o Coautor

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22 de septiembre de 2024
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Artículo
No

sabinaNSDM: An R package for spatially nested hierarchical species distribution modelling

Publicado en:Methods in Ecology and Evolution. 15 (10): 1796-1803 - 2024-09-12 15(10), DOI: 10.1111/2041-210X.14417

Autores: Mateo, Ruben G; Morales-Barbero, Jennifer; Zarzo-Arias, Alejandra; Lima, Herlander; Gomez-Rubio, Virgilio; Goicolea, Teresa

Afiliaciones

Univ Alcala De Henares, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Univ Autonoma Madrid, Ctr Invest Biodivers & Cambio Global CIBC UAM, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Univ Autonoma Madrid, Fac Ciencias, Dept Biol, Madrid, Spain - Autor o Coautor
Univ Castilla La Mancha, Sch Ind Engn Albacete, Dept Math, Albacete, Spain - Autor o Coautor
Univ Oviedo, Oviedo, Asturias, Spain - Autor o Coautor
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Resumen

1. Species distribution models have evolved to combine species-environment interactions across multiple scales. Spatially nested hierarchical models (NSDMs) offer a promising avenue by integrating datasets and predictive models from broad to fine scales. But a user-friendly tool to execute these models remains an important ongoing challenge. 2.To address this gap, we introduce the sabinaNSDM R package that provides a straightforward approach to develop NSDMs. This package merges global scale models, capturing extensive ecological niches, with regional scale models featuring high-resolution covariates, to form a unified hierarchical modelling framework. This toolkit is designed to facilitate the implementation of NSDMs for ecologists, conservationists and researchers aiming to produce more reliable species distribution predictions. 3. sabinaNSDM streamlines the data preparation, calibration, integration and projection of models across two scales. It automates (if necessary) the generation of background points, spatial thinning of species occurrence and absence (if available) data, covariate selection and the generation of NSDMs. 4. This paper outlines the workflow and functions integrated into the sabinaNSDM package, complemented by an applied case study involving a pool of 76 tree species. Consistent with previous publications, the generated NSDMs facilitated precise predictions (mean AUC value through independent evaluation higher than 0.88) of species distributions under current and future environmental scenarios.

Palabras clave

Ecological niche modelsEnsemble modellingHierarchical modellingNiche truncationScaleSpatial ecologySpecies distribution models

Indicios de calidad

Impacto bibliométrico. Análisis de la aportación y canal de difusión

El trabajo ha sido publicado en la revista Methods in Ecology and Evolution debido a la progresión y el buen impacto que ha alcanzado en los últimos años, según la agencia WoS (JCR), se ha convertido en una referencia en su campo. En el año de publicación del trabajo, 2024 aún no existen indicios calculados, pero en 2023, se encontraba en la posición 12/197, consiguiendo con ello situarse como revista Q1 (Primer Cuartil), en la categoría Ecology. Destacable, igualmente, el hecho de que la Revista está posicionada por encima del Percentil 90.

Impacto y visibilidad social

Desde la dimensión de Influencia o adopción social, y tomando como base las métricas asociadas a las menciones e interacciones proporcionadas por agencias especializadas en el cálculo de las denominadas “Métricas Alternativas o Sociales”, podemos destacar a fecha 2025-07-18:

  • El uso, desde el ámbito académico evidenciado por el indicador de la agencia Altmetric referido como agregaciones realizadas por el gestor bibliográfico personal Mendeley, nos da un total de: 32.
  • La utilización de esta aportación en marcadores, bifurcaciones de código, añadidos a listas de favoritos para una lectura recurrente, así como visualizaciones generales, indica que alguien está usando la publicación como base de su trabajo actual. Esto puede ser un indicador destacado de futuras citas más formales y académicas. Tal afirmación es avalada por el resultado del indicador “Capture” que arroja un total de: 36 (PlumX).

Con una intencionalidad más de divulgación y orientada a audiencias más generales podemos observar otras puntuaciones más globales como:

  • El Score total de Altmetric: 45.5.
  • El número de menciones en la red social Facebook: 1 (Altmetric).
  • El número de menciones en la red social X (antes Twitter): 44 (Altmetric).
  • El número de menciones en medios de comunicación: 1 (Altmetric).

Es fundamental presentar evidencias que respalden la plena alineación con los principios y directrices institucionales en torno a la Ciencia Abierta y la Conservación y Difusión del Patrimonio Intelectual. Un claro ejemplo de ello es:

Análisis de liderazgo de los autores institucionales

Existe un liderazgo significativo ya que algunos de los autores pertenecientes a la institución aparecen como primer o último firmante, se puede apreciar en el detalle: Primer Autor (GARCIA MATEO, RUBEN) .